Den unge fysikprofessorn Daniel Faraday arbetade under 90-talet som forskare vid Oxford-universitetet, på ett stipendie finansierat av Charles Widmore. Han kontaktades av skotten Desmond Hume - en i gruppen på ön - som sade att Daniel hade uppmanat honom att söka upp honom nu, 1996.

Han börjar förstå att hans experiment med tidsresor faktiskt kommer att lyckas i framtiden och fortsätter sin forskning med noggranna anteckningar i sitt ständigt närvarande block. Det ska också visa sig att han genom sina tidsresor har kunnat samla på sig värdefull information om Dharma Initiative.

Till ön kom han tillsammans med Charlotte Lewis, Miles Straume och deras pilot Frank Lapidus. Gruppen hade i uppdrag att förstöra Dharma-stationen Tempest och söka upp Benjamin Linus. Deras helikopter kraschade och de tillfångatogs av överlevande-gruppen som förhörde dem om deras bakgrund och uppsåt.

De lyckades övertyga gruppen om att de hade fredliga intentioner och tas motvilligt upp bland dem. Historien kunde också bekräftas av Desmond som upplevde att han slungas fram och tillbaka mellan 1996 och 2004.

Under tiden på ön hjälper Daniel till att hindra en giftgasläcka från en av Dharma-stationerna och mot slutet deltar han också i räddningsarbetet tillsammans med överlevarna.